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中科院微生物研究所微生物資源中心的詳細介紹
中國科學(xué)院微生物研究所微生物資源中心(IMCAS-BRC)是在中國普通微生物菌種保藏管理中心(CGMCC)和微生物所信息中心的微生物資源信息數據庫與共享平臺基礎上,通過(guò)設立微生物功能評價(jià)部門(mén),并完善質(zhì)量保證系統而組建的公益性機構。它在CGMCC的微生物物種保藏基礎上,重點(diǎn)加強了微生物資源深度開(kāi)發(fā)利用的研究以及資源質(zhì)量保證及其共享的標準體系。
IMCAS-BRC以科學(xué)家為主導,以技術(shù)人員為主體,依托微生物資源前期開(kāi)發(fā)國家重點(diǎn)實(shí)驗室和中國科學(xué)院真菌地衣系統學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗室的研究?jì)?yōu)勢,將注重認識并開(kāi)發(fā)利用微生物資源的功能;同時(shí),以“整合資源、認識功能、開(kāi)放共享、服務(wù)社會(huì )”為建設原則,IMCAS-BRC將對科研、教學(xué)及產(chǎn)業(yè)部門(mén)提供資源和技術(shù)服務(wù),并與國內外科研機構、產(chǎn)業(yè)實(shí)體開(kāi)展合作研發(fā)。
基于完善的信息數據系統,IMCAS-BRC與國際上多個(gè)微生物資源中心(BRC)合作共享資源信息,共建地區、乃至全球的BRC網(wǎng)絡(luò );同時(shí)按照經(jīng)濟合作與發(fā)展組織(OECD)的BRC標準,進(jìn)一步完善資源管理體系和質(zhì)量保證系統。
微生物資源前期開(kāi)發(fā)國家重點(diǎn)實(shí)驗室主任東秀珠研究員擔任IMCAS-BRC主任。IMCAS-BRC下設4個(gè)部門(mén):保藏部、功能評價(jià)部、信息部和質(zhì)量保證辦公室。保藏部主任為中國普通微生物菌種保藏管理中心主任周宇光;功能評價(jià)部主任為中國科學(xué)院真菌地衣系統學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗室研究員車(chē)永勝;信息部主任為微生物研究所信息中心主任馬俊才;質(zhì)量保證辦公室主任為微生物研究所工業(yè)微生物與生物技術(shù)研究室研究員張立新。
1.微生物資源中心保藏部
微生物資源中心保藏部(以下簡(jiǎn)稱(chēng)保藏部)以中國普通微生物菌種保藏管理中心(CGMCC)為基礎組建,宗旨是廣泛收集保藏各類(lèi)微生物菌株、細胞株和基因,為微生物資源的保護、共享和持續利用提供服務(wù)和支持。
CGMCC成立于1979年,是提供專(zhuān)業(yè)技術(shù)服務(wù)的公益性機構。作為國家知識產(chǎn)權局指定的專(zhuān)利微生物保藏中心,1995年被世界知識產(chǎn)權組織批準具有布達佩斯條約國際保藏單位資質(zhì)。保藏部建有菌種庫、細胞庫和基因庫。目前保藏各類(lèi)微生物菌種4000余種、35000余株(其中用于專(zhuān)利程序的培養物3200余株),并建有熱泉和牦牛瘤胃微生物群落元基因組BAC文庫和質(zhì)粒文庫(庫容量達76000個(gè)克隆、DNA插入片段達418 Mbp)。
保藏部設有高通量培養技術(shù)組、環(huán)境基因資源技術(shù)組、細胞培養技術(shù)組及快速準確鑒定技術(shù)組。技術(shù)人員目前正在建立一系列技術(shù)平臺,包括難培養和特殊環(huán)境微生物的高通量培養和保藏技術(shù)平臺,環(huán)境基因組文庫建立和保藏技術(shù)平臺,及準確快速物種鑒定技術(shù)平臺等。這些技術(shù)平臺的建設目標是獲得特殊類(lèi)群和特殊功能的微生物培養物及其功能基因,為微生物功能的利用貯備具有自主知識產(chǎn)權的資源。
保藏部對科研、教學(xué)和政府部門(mén)提供各類(lèi)微生物菌種和細胞株,保存用于專(zhuān)利程序的各種可培養生物材料,鑒定微生物菌種,并提供與微生物資源相關(guān)的技術(shù)咨詢(xún)和情報服務(wù)。CGMCC還與國內外微生物保藏及研究機構保持著(zhù)密切聯(lián)系。
2.微生物資源中心功能評價(jià)部
微生物資源中心功能評價(jià)部(以下簡(jiǎn)稱(chēng)功能評價(jià)部)以中國普通微生物菌種保藏管理中心(CGMCC)、微生物資源前期開(kāi)發(fā)國家重點(diǎn)實(shí)驗室、中國科學(xué)院真菌地衣系統學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗室的研究力量與菌種資源為依托,建立微生物功能活性物質(zhì)的高通量篩選技術(shù)體系和評價(jià)系統;利用該技術(shù)體系發(fā)現與人類(lèi)生活和健康密切相關(guān)的微生物代謝產(chǎn)物,最終形成一個(gè)開(kāi)放共享的生理活性及功能物質(zhì)的發(fā)現與評價(jià)技術(shù)平臺。
功能評價(jià)部主要開(kāi)展小分子化合物和蛋白質(zhì)(酶)的篩選與評價(jià)。以重要疾病包括傳染病、腫瘤等為靶標,建立小分子化合物高通量篩選模型及方法;以工業(yè)發(fā)展和人類(lèi)生活的需求為出發(fā)點(diǎn),建立高通量酶活篩選模型與方法,包括糖苷酶、蛋白酶、脂肪酶及其它重要工業(yè)用酶等。目的是促進(jìn)微生物資源的可持續利用。
功能評價(jià)部還將建立蛋白質(zhì)高效表達技術(shù)平臺,包括數種原核和真核生物表達系統,尤其是可同時(shí)表達數個(gè)基因的絲狀真菌/放線(xiàn)菌表達系統, 用于元基因組文庫中功能基因的表達。
功能評價(jià)部建有微生物次生代謝產(chǎn)物(粗提物)、部分純化(餾分)以及純化合物的樣品庫,同時(shí)建立了部分篩選模型與評價(jià)方法。本部將不斷擴充樣品庫的庫容量,建立和引進(jìn)多個(gè)篩選模型,拓展功能篩選和評價(jià),并對外開(kāi)放,積極開(kāi)展與研究及產(chǎn)業(yè)部門(mén)的合作。
3. 微生物資源中心信息部
微生物資源中心信息部(以下簡(jiǎn)稱(chēng)信息部)設立于微生物研究所的信息中心,致力于建設微生物資源信息管理平臺、建立數據標準與數據規范、開(kāi)發(fā)微生物資源數據庫和建設對外信息共享門(mén)戶(hù)。
信息部作為中國科學(xué)院典型培養物委員會(huì )信息中心、亞洲微生物資源保藏與可持續利用協(xié)會(huì )中國節點(diǎn)、國際生物鏡像網(wǎng)中國國家節點(diǎn)、Global BRC Network成員單位,長(cháng)期以來(lái)致力于我國微生物資源的信息化,目前已經(jīng)建立了微生物菌種信息數據庫、物種生理生化性狀數據庫、核酸序列數據庫、菌種銷(xiāo)售數據庫、客戶(hù)管理數據庫、中國科學(xué)院典型培養物數據庫、亞洲微生物資源目錄數據庫,并建立了我國微生物學(xué)領(lǐng)域最大的信息共享網(wǎng),可共享數據資源超過(guò)1TB。信息部開(kāi)發(fā)的微生物資源管理系統,已被我國多家微生物資源保藏中心使用,并作為亞洲微生物資源網(wǎng)的信息門(mén)戶(hù)平臺。
目前,信息部會(huì )同保藏部和質(zhì)量保證辦公室,在維護和更新現有各數據庫系統的基礎上,正在建立高通量篩選數據庫、指紋圖譜/分子標識數據庫、微生物條形碼庫、微生物志數據庫和生物信息數據庫。此外,信息部正在開(kāi)發(fā)微生物資源專(zhuān)用檢索引擎和生物信息學(xué)超級計算平臺。
4. 微生物資源中心質(zhì)量保證辦公室
微生物資源中心質(zhì)量保證辦公室負責中心的微生物資源和技術(shù)服務(wù)質(zhì)量管理、知識產(chǎn)權管理和生物安全管理,以及中心的宣傳等工作。目標是通過(guò)規范化管理,達到保證技術(shù)服務(wù)質(zhì)量、保護知識產(chǎn)權、杜絕安全事故的目的。
質(zhì)量保證辦公室的職責包括如下三方面:
1.中心的資源及技術(shù)服務(wù)的質(zhì)量保證工作:制定并組織建設中心的質(zhì)量管理體系,編制管理文件,組織內部審核等;組織實(shí)施實(shí)驗室認可、計量認證工作,聯(lián)絡(luò )評審機構;組織實(shí)施質(zhì)量體系培訓計劃和能力驗證等質(zhì)量控制工作;協(xié)助工作委員會(huì )評估中心各部門(mén)的年度質(zhì)量報告。
2.知識產(chǎn)權管理工作:制訂中心微生物資源相關(guān)的知識產(chǎn)權工作規劃和計劃;執行國家知識產(chǎn)權局和世界知識產(chǎn)權組織下達的工作;組織中心科研人員的知識產(chǎn)權法律、法規培訓;協(xié)助研究所知識產(chǎn)權主管行政部門(mén)審查、簽訂中心與國內外研究、開(kāi)發(fā)機構的知識產(chǎn)權合作協(xié)議和技術(shù)合作協(xié)議。
3.生物安全管理工作:制定實(shí)驗室生物安全技術(shù)方案和實(shí)驗室生物安全事故應急預案;組織中心科研人員開(kāi)展實(shí)驗室生物安全事件應急知識和處理技術(shù)的培訓;評估、確定保藏部受理保藏微生物菌種的生物危害等級;協(xié)助研究所生物安全主管行政部門(mén)組織實(shí)驗室生物安全檢查,監督實(shí)驗廢棄物處理;發(fā)生實(shí)驗室安全事件時(shí),負責向研究所主管部門(mén)報告,啟動(dòng)應急預案,及時(shí)組織現場(chǎng)處置。
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